Eikon Therapeutics fait face à une croissance explosive de ses données grâce à Qumulo
Eikon Therapeutics est une société de biotechnologie au stade clinique qui fait progresser la thérapeutique grâce à l'intégration délibérée de l'ingénierie et de la science. Son équipe d'experts en biologie, en chimie médicinale et en pharmacologie analyse le comportement des protéines à l'échelle de la molécule dans les cellules vivantes, afin de découvrir de nouvelles thérapies médicamenteuses potentielles. Pour ce faire, ils suivent, mesurent et analysent la dynamique des protéines afin de déterminer quels médicaments pourraient prolonger ou améliorer la vie des patients atteints d'une maladie grave. Afin d'effectuer ce travail à forte intensité de données, ils s'appuient sur une pile technologique robuste qui comprend Qumulo.
Lors d'une récente conférence, le PDG de Qumulo, Bill Richter, a souligné qu'"il existe des milliers de protéines qui jouent un rôle important dans les organismes vivants, mais on sait peu de choses à leur sujet"
Dans le cadre de la conversation, Patrick McNamara, directeur de l'ingénierie informatique chez Eikon Therapeutics, a expliqué l'un des principaux éléments de leur pile technologique - la microscopie à fluorescence à super-résolution sur cellules vivantes, créée par le cofondateur Eric Betzig, PhD, et d'autres collaborateurs. Le Dr Betzig a reçu le prix Nobel en 2014 pour ses travaux dans ce domaine
dans ce domaine.
Base de la pile technologique d'Eikon, le Single Molecule Tracking (SMT) utilise des colorants fluorescents et la vidéo pour voir et mesurer les mouvements entre les protéines dans une cellule vivante. Il s'agit d'une technique très détaillée, avec une imagerie vidéo à haute résolution et des fréquences d'images rapides, ce qui se traduit par de grandes quantités de données à gérer
à gérer.
La gestion du stockage des données non structurées répond aux besoins des entreprises
Les données touchent presque tous les aspects de l'activité d'Eikon. "C'est ce qui fera de nous une entreprise prospère", a expliqué M. McNamara. Au fur et à mesure que l'entreprise se développe, s'étend et effectue des recherches pour améliorer les pipelines biologiques et chimiques, les données générées par ses instruments SMT continuent de croître à un rythme exponentiel. Ils doivent garder les données à la fois protégées et accessibles compte tenu des implications sérieuses de leur recherche, et avec des plans pour continuer à faire évoluer sa découverte de médicaments axée sur les protéines, Eikon a été attiré par Qumulo en raison de la protection des données, de l'évolutivité, de la compatibilité avec le cloud et des fonctionnalités différentiantes.
"J'ai fait beaucoup d'investigations lorsque nous avons fait notre premier achat de stockage. Connaissant notre ensemble de données et ce que nous devons faire à l'avenir, des fonctionnalités telles que l'accès API, la réplication et Qumulo Shift sont essentielles à la gestion de nos données", a déclaré McNamara.
L'ensemble des données d'Eikon est important en termes de taille et de nombre de fichiers, ce qui implique d'effectuer un grand nombre d'opérations de curation et de vieillissement des données. Pour augmenter facilement le stockage de plus d'un ordre de grandeur depuis leur achat initial de petite taille en 2020, McNamara apprécie le fait d'avoir peu ou pas d'impact sur leur environnement opérationnel. "Nous pouvons cliquer sur un bouton, revenir un jour plus tard et tout est rééquilibré. Pour moi, c'est une victoire", a-t-il ajouté.
Eikon se prépare à un environnement de données dynamique basé sur l'informatique en nuage
Eikon estime qu'ils généreront bientôt près d'un pétaoctet de données par jour.
Nous utilisons les protocoles SMB, NFS et objet, et le fait de ne pas avoir à se préoccuper de la mise en place d'un système qui traduise le mode de communication de notre baie de stockage vers Linux, Windows ou d'autres protocoles me facilite la vie et aide notre équipe scientifique à accéder aux données qu'elle souhaite.
Patrick McNamara
Directeur de l'ingénierie informatique, Eikon Therapeutics
Au cours de l'année à venir, Eikon prévoit d'étendre la génération et la consommation de données à plusieurs sites et probablement aussi à l'informatique en nuage. Son équipe de stockage restera relativement petite et elle doit donc s'appuyer sur des partenaires technologiques fiables et de confiance pour l'aider à suivre le rythme. Qumulo est un partenaire de confiance pour Eikon, offrant un stockage simple à mettre en œuvre et facile à gérer. Et Eikon a le choix de déployer la plate-forme de données de fichiers multi-cloud de Qumulo lorsqu'ils s'étendent au cloud, ce qui crée une plus grande valeur de partenariat pour McNamara, son équipe en pleine croissance et la direction d'Eikon Therapeutics.
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