프로제니티는 환자 치료를 개선하기 위한 생명공학 연구를 수행합니다. 유전자 염기서열 분석 작업은 진단 테스트에 사용되는 수십억 개의 작은 파일을 생성하며, 이 모든 파일은 Qumulo의 파일 데이터 관리 플랫폼에 보관됩니다.
Progenity, Inc. 는 임상의에게 여성 건강, 생식 의학 및 종양학을 위한 복잡한 분자 및 전문 진단 검사를 제공하는 생명공학 회사입니다. 프로제니티는 유전자 보균자 검사, CFDNA 검사, 암 검사와 같은 분야에서 유전자 시퀀싱 연구를 수행하여 정보의 확산을 장려하고 궁극적으로 더 나은 환자 치료로 이어지는 데이터를 업계에 제공합니다.
2012년에 설립되어 현재 500명 이상의 직원이 근무하고 있으며 빠르게 성장하고 있습니다. 샌디에이고에 본사를 두고 있으며, 미시간주 앤아버와 텍사스주 댈러스에 실험실과 운영 시설을 갖추고 있습니다. 회사가 계속 확장됨에 따라 데이터 스토리지 수요도 기하급수적으로 증가하고 있습니다.
데이터 집약적인 유전자 염기서열 분석 워크로드가 증가함에 따라 수십억 개의 파일을 위한 효율적이고 확장 가능한 스토리지가 필요합니다
지난 수년간 Progenity는 유전자 염기서열 분석 작업을 통해 10억 개 이상의 파일을 생성했습니다. Progenity의 Linux 및 Windows 애플리케이션 솔루션 아키텍트인 데이비드 마이저는 "그 속도는 점점 빨라지고 있습니다. 2년 안에 10억 개의 파일을 더 확보할 수 있을 것입니다."라고 말합니다
빠른 성장과 데이터 집약적인 워크플로우로 인해 Progenity는 이전 스토리지 공급업체로는 향후 요구 사항을 충족할 수 없다는 것을 알고 있었습니다. "기존 스토리지 시스템을 몇 년 사용한 후, 우리는 회사의 업무 방식이 우리에게 적합한 모델이 아니라는 것을 깨달았습니다."라고 마이저는 높은 비용과 스토리지 효율성을 모두 언급하며 말합니다.
"항상 존재했던 한 가지 문제는 파일 오버헤드가 상당히 크다는 것이었습니다. 우리가 작성하는 파일은 매우 작고, 기존 스토리지 시스템의 블록 크기는 매우 컸습니다."라고 마이저는 설명합니다. "액세스 시간이 너무 길어 제자리에서 분석을 수행할 수 없다는 사실을 알게 되었습니다."
온프레미스 또는 클라우드에서 빠르게 액세스하여 유전자 염기서열 분석 작업의 가성비 향상
프로제니티는 2016년에 기존 공급업체를 대체하기 위해 하이브리드 클라우드 환경을 위한 Qumulo 파일 데이터 플랫폼을 선택했습니다. Qumulo는 성능이나 확장성을 저하시키지 않으면서도 합리적인 가격의 솔루션을 Progenity에 제공할 수 있었습니다. 또한 Qumulo 스토리지는 온프레미스와 퍼블릭 클라우드에서 모두 실행되므로, 클라우드로의 마이그레이션을 계획하고 있는 Progenity에게 또 다른 주요 이점이 되었습니다.
마이스너에 따르면 솔루션 아키텍트는 "Qumulo는 작은 파일을 매우 잘 처리하며, 이는 다시 비용으로 돌아와서 비용 밀도가 개선되고 있기 때문입니다. 기가바이트의 데이터에 대해 레거시 시스템과 동일한 비용을 지불하더라도 Qumulo를 사용하면 비용 대비 더 나은 가치를 얻을 수 있습니다."
마이저는 보수적으로 추산했을 때 프로제니티는 이전 공급업체에 비해 Qumulo를 통해 13%의 스토리지 공간을 절약할 수 있다고 예상했지만, 실제 절감 효과는 17~20%에 달할 것이라고 언급했습니다.
성공 요인: 실시간 가시성, 다양한 파일 액세스 프로토콜 지원, 클라우드로의 손쉬운 이동 경로
Qumulo의 제공 능력 데이터 사용량에 대한 실시간 가시성 핫스팟과 비효율성을 포함하여 중요한 이점임이 입증되었습니다. "이제 저희는 매우 만족하고 있습니다. 레거시 시스템에서 Qumulo로 마이그레이션하는 과정에서 연구 개발팀이 어떤 파일을 삭제할 수 있는지 파악할 수 있었기 때문에 저장 공간을 낭비하지 않을 수 있었습니다."
네트워크 파일 시스템(NFS)과 서버 메시지 블록(SMB) 프로토콜을 모두 지원하는 Qumulo의 또 다른 장점은 Progenity의 또 다른 핵심 이점입니다. 마이스너는 "SMB를 통해 데이터를 쓰고 NFS를 통해 데이터를 다시 읽을 수 있어야 합니다. 이것이 바로 우리가 데이터를 분석하는 방식에 대한 우리의 큰 이야기입니다."
프로제니티의 데이터 입력은 일루미나 시퀀서에서 제공되며, 이 시퀀서는 SMB를 통해 Qumulo 클러스터로 직접 결과를 전달합니다. 데이터는 또한 NFS 프로토콜을 사용하여 실제 계산 분석에 사용되는 로컬 스토리지를 포함하는 NGS(차세대 시퀀싱) 컴퓨팅 클러스터로 복사됩니다.
이 회사는 차세대 염기서열 분석(NGS) 컴퓨팅 클러스터를 클라우드로 이전하고 Qumulo를 사용해 AWS의 퍼블릭 클라우드 스토리지를 관리할 계획입니다. Qumulo의 지속적인 복제 기능은 로컬 공유가 최신 상태로 유지되도록 보장합니다. Qumulo의 고객 관리 팀이 성공을 보장하기 위해 최선을 다할 것입니다.
"모든 수준에서 Qumulo로부터 받은 답변에 매우 만족하고 있습니다."라고 Meisner는 말합니다. "가장 큰 장점 중 하나는 크든 작든 모든 종류의 질문에 대해 Qumulo Care에 즉시 연락할 수 있는 Slack 채널이 있다는 점입니다. 이 기능을 많이 사용하고 있으며 정말 마음에 듭니다."
전문 읽기 사례 연구: 프로제니티의 미래 계획 수립을 지원합니다: 서비스, 가치 및 규모
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