Progenity는 환자 치료를 개선하기 위해 생명공학 연구를 수행합니다. 유전자 시퀀싱 작업은 진단 테스트에 사용되는 수십억 개의 작은 파일을 생성하고 이 파일 모두는 Qumulo의 파일 데이터 관리 플랫폼에 보관됩니다.
(주)프로제니티 임상의에게 여성 건강, 생식 의학 및 종양학에 대한 복잡한 분자 및 전문 진단 테스트를 제공하는 생명공학 회사입니다. Progenity는 정보 확산을 촉진하고 궁극적으로 업계에 더 나은 환자 치료로 이어지는 데이터를 제공하기 위해 유전자 보인자 테스트, CFDNA 스크리닝 및 암 테스트와 같은 영역에서 유전자 시퀀싱 연구를 수행합니다.
이 회사는 2012년에 설립되었으며 현재 500명 이상의 직원이 있으며 빠르게 성장하고 있습니다. 샌디에이고에 있는 본사 외에도 미시간주 앤아버와 텍사스주 댈러스에 연구소 및 운영 시설이 있습니다. 회사가 계속 확장됨에 따라 데이터 스토리지 요구 사항은 기하급수적으로 계속 증가합니다.
증가하는 데이터 집약적 유전자 시퀀싱 워크로드에는 수십억 개의 파일을 위한 효율적이고 확장 가능한 스토리지가 필요합니다.
수년에 걸쳐 Progenity의 유전자 시퀀싱 작업은 XNUMX억 개 이상의 파일을 생성했습니다. Progenity의 Linux 및 Windows 애플리케이션용 솔루션 아키텍트인 David Meiser에 따르면 “그 속도는 가속화되고 있습니다. XNUMX년 안에 또 다른 XNUMX억 개의 파일이 있을 수 있습니다."
Progenity는 급속한 성장과 데이터 집약적 워크플로우로 인해 이전 스토리지 공급업체가 미래의 요구 사항을 충족할 수 없다는 것을 알고 있었습니다. Meiser는 높은 비용과 스토리지 효율성을 언급하면서 "우리의 원래 스토리지 시스템을 사용한 지 몇 년 후에 회사의 일하는 방식이 우리에게 좋은 모델이 아니라는 것을 깨달았습니다."라고 말했습니다.
“항상 존재하는 한 가지 문제는 상당한 파일 오버헤드가 있다는 것이었습니다. 우리가 쓰는 파일은 매우 작고 기존 스토리지 시스템의 블록 크기는 매우 컸습니다.”라고 Meiser가 설명했습니다. "액세스 시간이 너무 길기 때문에 현장에서 분석을 수행할 수 없다는 것을 발견했습니다."
온프레미스 또는 클라우드에서 빠르게 액세스하여 유전자 시퀀싱 작업을 위한 더 나은 비용 밀도 가치
Progenity는 2016년에 기존 공급업체를 대체하기 위해 하이브리드 클라우드 환경용 Qumulo 파일 데이터 플랫폼을 선택했습니다. Qumulo는 성능이나 확장성을 희생하지 않으면서 Progenity를 위한 저렴한 솔루션을 제공할 수 있었습니다. 또한 Qumulo 스토리지는 온프레미스와 퍼블릭 클라우드 모두에서 실행되며, 이는 Progenity가 계획한 클라우드 마이그레이션의 또 다른 주요 이점입니다.
마이스너에 따르면. Solutions Architect, “Qumulo는 작은 파일을 매우 잘 처리하지만 비용 밀도가 높아져 다시 비용으로 되돌아갑니다. Qumulo의 기가바이트 데이터에 대해 레거시 시스템에 대해 동일한 비용을 지불하더라도 여전히 비용 대비 더 나은 가치를 얻을 수 있습니다.”
Meiser는 Progenity가 이전 공급업체에 비해 Qumulo를 사용하여 저장 공간을 보수적으로 13% 절약할 것이라고 추정했지만 실제 절약은 아마도 17~20% 이상일 것이라고 언급했습니다.
성공 요인: 실시간 가시성, 여러 파일 액세스 프로토콜 지원 및 클라우드로의 쉬운 경로
제공하는 Qumulo의 능력 데이터 사용에 대한 실시간 가시성, 핫스팟 및 비효율성을 포함하여 중요한 이점으로 입증되었습니다. “이제 우리는 그것을 가지고 매우 감사합니다. 레거시 시스템에서 Qumulo로 마이그레이션하면서 연구 및 개발 담당자가 삭제할 수 있는 파일을 파악할 수 있어 스토리지를 낭비하지 않았습니다.”
네트워크 파일 시스템(NFS)과 서버 메시지 블록(SMB) 프로토콜을 모두 지원하는 Qumulo는 Progenity의 또 다른 주요 이점입니다. 마이스너에 따르면, “SMB를 통해 데이터를 쓰고 NFS를 통해 해당 데이터를 다시 읽을 수 있어야 합니다. 이것이 우리가 데이터를 분석하는 방법에 대한 우리의 큰 이야기입니다.”
Progenity의 데이터 입력은 SMB를 통해 Qumulo 클러스터에 직접 결과를 전달하는 Illumina 시퀀서에서 가져옵니다. 데이터는 또한 NFS 프로토콜을 사용하여 실제 계산 분석에 사용되는 로컬 스토리지를 포함하는 NGS(차세대 시퀀싱) 컴퓨팅 클러스터에 복사됩니다.
이 회사는 차세대 시퀀싱(NGS) 컴퓨팅 클러스터를 클라우드로 이전하고 Qumulo를 사용하여 AWS에서 퍼블릭 클라우드 스토리지를 관리할 계획입니다. Qumulo의 연속 복제 기능은 로컬 공유가 최신 상태로 유지되도록 합니다. Qumulo의 고객 관리 팀은 성공을 보장하기 위해 대기할 것입니다.
Meisner는 "우리는 모든 수준에서 Qumulo로부터 얻은 답변에 매우 만족합니다."라고 말했습니다. “가장 큰 판매 포인트 중 하나는 크든 작든 모든 종류의 질문에 대해 Qumulo Care에 즉시 연락할 수 있는 Slack 채널이 있다는 것입니다. 우리는 이 기능을 많이 사용하고 있으며 정말 좋아합니다.”
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